Научно-исследовательская деятельность Библиотеки Первого Президента Республики Казахстан – Елбасы направлена на постоянное совершенствование научно обоснованной методологии освещения событий новейшей истории; планирование, организацию и проведение научных исследований по истории становления и развития Республики Казахстан; организацию и проведение научно-поисковой и источниковедческой работы; научно-образовательную деятельность, методико-консультационную работу, популяризацию и пропаганду результатов научно-исследовательской деятельности Библиотеки Елбасы, прикладные исследования по вопросам музееведения.
Важное значение в научно-исследовательской работе отводится специализации каждого научного сотрудника. Проводятся научные исследования по вопросам: конституционного строительства независимого Казахстана, социальной политики Республики Казахстан, становления и развития столицы независимого Казахстана, изучения казахстанского опыта межконфессионального и межэтнического согласия, укрепления стратегии многовекторной политики Республики Казахстан и её внешнеполитического авторитета.
Научно-поисковая и источниковедческая работа направлена на сбор и систематизацию сведений о наиболее важнейших событиях в истории суверенного Казахстана; исторических деятелях, внесших весомый вклад в становление государственности. С этой целью проводятся научно-поисковые экспедиции, командировки в архивы, библиотеки республики; выявляются и вводятся в научный оборот новые факты, исторические материалы.
Прикладные научные исследования в области музееведения и архивоведения способствуют дальнейшему изучению и популяризации предметов музейного и архивного собрания Библиотеки Елбасы.
Проведение исследований в области музейной коммуникации сочетает музееведческие и научно-педагогические исследования и осуществляется в области изучения общественного мнения по реализации Научно-образовательной программы Библиотеки Елбасы. В этом направлении осуществляются разработка и проведение системы мониторинга посетителей, обработка социологических анкет, анализ образовательной деятельности, подготовка полугодовых и годовых отчетов по результатам мониторинга. По результатам социологических опросов и их анализа разрабатываются рекомендации по вопросам совершенствования научно-образовательной деятельности.
Одной из форм стратегического планирования основных направлений научных исследований стали научные программы, реализуемые с 2007 года.
Научно-исследовательские проекты ориентированы на широкое сотрудничество с ведущими отечественными и зарубежными учеными, исследователями, специалистами вузов, научных организаций. По итогам исследований научными сотрудниками подготовлены к изданию различные виды печатных изданий (коллективные монографии, сборники статей, сборники материалов и документов, альбомы, брошюры, информационно-справочные издания, научно-справочные материалы и т.д.).
Сосредоточенные в фондах Библиотеки Елбасы архивные документы и экспонаты содержат уникальные по своей значимости материалы и являются объектами изучения и проведения научных исследований. В этом направлении большое внимание уделяется выявлению, изучению и использованию материалов Личного архива, Личной Библиотеки Елбасы, музейного фонда. Введение в научный оборот этого комплекса источников создает условия для последующих фундаментальных исследований по актуальным общественно-политическим темам.
Ocнoвнoй фopмoй фopмиpoвaния иcтoчникoвoй бaзы научных исследований являютcя нayчныe кoмaндиpoвки и экcпeдиции.
О результативности научно-исследовательской деятельности свидетельствует ряд крупных научных конференций и круглых столов, проведение которых стало значимым событием в жизни Библиотеки Елбасы.